Als die Gefahr durch das Dominion bekannt wird, kommt Lt. Commander Eddington nach DS9, um dort die Sicherheit der Föderation zu leiten, da das Sternenflottenkommando Odo nicht vollständig traut.
Eddington tritt dem Maquis bei, verlässt jedoch noch nicht die Sternenflotte, sondern gibt Informationen an den Maquis weiter und sabotiert die Defiant. Schließlich lockt er Sisko von der Station fort und stiehlt in seiner Abwesenheit für Cardassia bestimmte Industriereplikatoren. Sikso nimmt diese Verrat sehr persönlich, da er Eddington vertraut hat.
Eddington steigt bis zum Führer einer Maquis-Zelle auf und verübt schließlich mit biologischen Waffen Anschläge zwei Planeten in der Entmilitarisierten Zone. Als Resultat seiner Anschläge, können dort keine Cardassianer mehr leben. Sisko dreht den Spieß jedoch um und droht damit sämtliche Planeten in der Zone für Menschen unbewohnbar zu machen, wenn sich Eddington nicht ergibt und die Waffen übergibt. Da dieser keine andere Möglichkeit sieht seine Leute und ihre Heimatwelten zu schützen, ergibt er sich. Eddington wird anschließend auf einer Sternenbasis gefangen gehalten.
Als das Dominion den Maquis vernichtet, überlebt er deswegen, macht sich aber große Vorwürfe, da er nichts unternehmen konnte. Eddington belügt Sisko und kommt so aus der Haft. Er hat behauptet, dass der Maquis Massenvernichtungswaffen nach Cardassia schicken wird und so einen Krieg zwischen den Cardassianern und der Föderation auslösen will. Dies ist jedoch nur ein Trick, mit dem er Freunde und seine Frau von einem Planeten in den Badlands retten will. Bei dieser Rettungsaktion stirbt er, seine Maquis-Gefährten können jedoch gerettet werden.