Thomas Eugene Paris wird 2346 als Sohn von Owen Paris auf der Erde geboren. Tom tritt als Admiralssohn nur der Sternenflotte bei, um die Karriere anzufangen, die sein Vater immer für ihn wollte, ohne es selbst wirklich zu wollen.
Auf der Akademie entdeckt er seine Leidenschaft für das Fliegen, begeht dann jedoch einen Pilotenfehler, der zum Tod von drei Kadetten führt. Tom fälscht die Flugberichte und lügt bei der folgenden Anhörung, womit er ohne Strafe aus der Sache herauskommt. Sein Gewissen quält ihn jedoch so sehr, dass er schließlich seinen Fehler und die Fälschung der Berichte gesteht und unehrenhaft aus der Sternenflotte entlassen wird.
Tom geht nach Frankreich und widmet sich dem Alkohol, den Frauen und Pool spielen. Er trifft auf Chakotay, welcher ihn für den Maquis anwerben will. Da er endlich wieder Raumschiffe fliegen will, stimmt er zu. Die Sternenflotte schnappt ihn jedoch, als er für den Maquis auf einer Mission ist und schickt ihn als Gefangenen in ein Gefängnis nach Auckland, Neuseeland.
Captain Janeway holt ihn aus dem Lager und nimmt ihn als Berater mit auf die Voyager, da er einer der besten verfügbaren Piloten und Badlands-Experten ist. Als die Voyager im Delta-Quadranten strandet, wird er im Rang eines Lieutenants JG wieder in den aktiven Dienst übernommen und ersetzt die getötete Lieutenant Stadi als Steuermann der Voyager.
Zunächst wird er von der Sternenflottencrew und auch den ehemaligen Maquis als Verräter angesehen, nachdem er Chakotays Leben rettet, verspricht dieser ihm jedoch Schutz. Im Laufe der Zeit erlangt er den Respekt und die Achtung der gesamten Besatzung als zuverlässiger Steuermann der Voyager. Hin und wieder muss er als Sanitäter den Doctor auf der Krankenstation unterstützen.
Wegen einer Befehlsverweigerung wird er zum Ensign degradiert, später jedoch wieder zum Lieutenant JG befördert.
Captain Janeway schlägt Paris für eine Ehrung vor, da er mit einem modifizierten Shuttle erstmals Warp 10 und damit Transwarpgeschwindigkeit erreicht. Das Experiment hat jedoch massive Auswirkungen auf ihn und er entwickelt sich innerhalb von 24 Stunden in eine mögliche zukünftige Form des Menschen, die an einen Molch erinnert. Die Veränderungen können vom Doctor wieder rückgängig gemacht werden.
Admiral Paris ist Hauptbefürworter des Pathfinder-Projekts, um Kontakt zur Voyager herzustellen und das Schiff mit seinem Sohn zurückzuholen. Das angespannte Verhältnis zu seinem Vater wird durch die große Entfernung nach und nach besser, als sie wieder Kontakt mit der Heimat aufnehmen können.
Schon zu Beginn der Reise freundet er sich mit Harry Kim an. Gemeinsam gehen sie derLeidenschaft Holo-Romane durchzuspielen und zu programmieren nach. Tom verliebt sich zunächst in Kes, geht später aber eine Liebesbeziehung zu B'Elanna Torres ein. Nachdem beide heiraten, bekommen sie eine gemeinsame Tochter, Miral. Erst möchte B'Elanna die klingonischen Merkmale des Fötus vom Doctor entfernen lassen, damit es wie ein rein menschliches Kind aussieht. Tom überzeugt sie jedoch davon, dass ihrem Kind druch dessen klingonisches Erbe nicht die gleiche schwierige Kindheit bevorsteht, wie sie B'Elanna hatte und sie verzichten darauf am ungeborenen Kind genetische Veränderungen vorzunehmen.